На территории современного штата Айова люди живут более чем тринадцать тысяч лет. Как и практически во всех штатах США, до прихода европейцев коренными жителями земель Айовы были американские индейцы.
Здесь жили около полутора десятков различных индейских племен, в том числе индейцы айова (в честь которых и был назван штат), сок, месквоки (фокс), сиу, потаватоми, ото, миссури и другие.
В семнадцатом веке, когда на территории Айовы появились первые европейцы, большинство местных индейцев были оседлыми земледельцами со сложившейся культурой, экономической и политической системами.
В 1673 году экспедицией французов Жака Маркетта и Луи Жолье, спускавшейся по великой американской реке Миссисипи, были впервые описаны индейские поселения на территории современной Айовы. Эти земли были объявлены принадлежащими Франции, они входили в состав провинции Луизиана колонии Новая Франция.
В 1763 году земли Луизианы к западу от Миссисипи были переданы Испании, а в 1800 году вновь стали французскими. В 1803 году Соединенные Штаты Америки купили Луизиану у французов.
В 1805 году земли Айовы были исследованы и описаны знаменитым американским первопроходцем Зебулоном Пайком. Первым постоянным американским поселением в Айове стал построенный в 1808 году Форт Мэдисон (сейчас на его месте одноименный город).
Во время англо-американской войны 1812-15 годов, а именно в 1813 году, Форт Мэдисон был захвачен англичанами и помогавшими им индейцами во главе с известным вождем племени сок Черным Ястребом. Соединенные Штаты восстановили контроль над Айовой лишь после окончания войны.
Правительство США проводило политику вытеснения индейских племен на запад, что зачастую приводило к вооруженным конфликтам. Так в тридцатых годах XIX века на территории Айовы и соседних Висконсина и Иллинойса произошли несколько столкновений, известных по имени лидера индейцев как "Война Черного Ястреба". Окончательно из Айовы индейцы были выселены в пятидесятых годах XIX века, хотя многие из них впоследствии вернулись на родные земли.
В тридцатых годах XIX века в Айову начали приезжать переселенцы, в основном из Вирджинии, Индианы, Кентукки, Нью-Йорка, Огайо и Пенсильвании.
В 1838 году Конгрессом США была создана территория Айова, а в 1846 году Айова стала двадцать девятым штатом США.
Мощным толчком для развития экономики Айовы послужило строительство в пятидесятых-шестидесятых годах XIX века железных дорог.
Во время Гражданской войны в США население Айовы активно поддерживало северян, направив в армию около семидесяти пяти тысяч добровольцев. Кроме того, штат обеспечивал продовольствием как воинские подразделения, так и города Восточного побережья США.
После окончания Гражданской войны в США продолжается бурный рост населения штата (практически в два раза за десятилетие с 1860 по 1870 годы). Иммиграция в Айову всячески поощрялась правительством США, на английском, немецком, голландском, шведском и датском языках была издана девяностошестистраничная рекламная брошюра "Айова - дом для иммигрантов". Активная пропаганда дала свои плоды, в штат массово ехали переселенцы, в основном из Германии и скандинавских стран. Продолжалось развитие сельского хозяйства в Айове.
Во второй половине XIX - начале XX веков в Айове добывали уголь, причем на шахтам в основном работали выходцы с юга Европы (итальянцы, хорваты) и переселившиеся в Айову с Юга США чернокожие американцы.
С начала XX века в преимущественно сельской Айове начали расти города и развиваться промышленность. Очередной скачок в развитии штата (как и всей страны) произошел во время Первой мировой войны. Однако сменившая период процветания Великая депрессия очень сильно ударила по фермерским хозяйствам штата. Значительная поддержка сельскохозяйственным производителям была оказана в рамках "Нового курса", проводимого тридцать вторым Президентом США Франклином Рузвельтом. Кстати одним из соратников Рузвельта и создателей политики "Нового курса" был выходец из Айовы Генри Уоллес, ставший впоследствии вице-президентом США.
Кризис двадцатых-тридцатых годов продемонстрировал, что необходимо разнообразить сферы экономической деятельности штата, не ограничиваясь лишь сельским хозяйством. Это еще раз потвердил сильнейший кризис сельского хозяйства в восьмидесятых годах XX века, из-за которого даже сократилось население штата.
Ошибки были учтены, в последние десятилетия в штате активно развивалась промышленность, в том числе и ее высокотехнологичные направления, а также финансы, страхование, биотехнологии, государственная служба и другие отрасли. Для современной Айовы характерно достаточно стабильное развитие на фоне сбалансированной экономики.